2008年开始申报，2011年由内蒙古科技厅正式批准为“内蒙古自治区蒙医药重点实验室”。由蒙医药学院院长奥·乌力吉教授担任重点实验室主任。
现有专职人员32人，其中教授15人，副教授6人，高级实验师1人，博士10人，硕士8人，硕士生导师15人，兼职博士生导师2人。实验室现有房屋面积1400m2，仪器设备1000余台件，总价值1500万元。
重点实验室面向民族医学、蒙西医结合临床医学、蒙西医结合基础医学和蒙药学一级学科四个硕士学位点，开放于硕士生毕业课题研究。主要研究方向有：
1.蒙医药基础理论研究。
2.蒙药资源与质量标准研究。
3.蒙药有效物质及新药开发研究。
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